學校現有1個國家級人文社科重點研究基地(國家革命文物協同研究中心),1個國家工程技術研究中心(國家單糖化學合成工程技術研究中心),1個國家淡水魚加工技術研發專業中心,1個國家大學科技園,2個國際科技合作基地(無機膜材料國際科技合作基地、網絡化支撐軟件國際科技合作基地),2個教育部重點實驗室(鄱陽湖濕地與流域研究教育部重點實驗室、氟硅能源材料與化學教育部重點實驗室),1個國家體育總局重點實驗室(水上項目訓練監控及干預重點實驗室),1個教育部國別和區域研究中心(馬達加斯加研究中心),1個外交部國別和區域研究中心(中日韓合作研究中心),1個全國高校輔導員發展研究中心,1個國家級科技服務平臺(高校學生科技創業實習基地),6個省“2011協同創新中心”,3個省高校高水平創新平臺立項建設項目(1個實驗室和2個工程研究中心),1個省應用數學中心,9個省級重點實驗室,5個省級工程技術研究中心,3個江西省產學研合作示范培育基地,5個省產業技術工程化中心,9個省哲學社會科學重點研究基地,2個省級高端智庫,8個省教育廳人文社科重點研究基地,1個省級管理科學研究基地,2個省文化廳文化藝術科學重點研究基地,1個省級軟科學研究基地。
學校聚焦重大科研創新,優化組織模式,加強團隊建設和梯隊培養,不斷提升創新能力。近5年來,獲國家自然科學基金378項,其中重點5項。獲國家社會科學基金170項,重大招標項目8項,其中年度項目立項數連續8年位居全國高校50強。學校共辦有學術期刊7本,其中《江西師范大學學報(自然科學版)》《江西師范大學學報(哲學社會科學版)》《心理學探新》等3本刊物為“全國中文核心期刊”,《江西師范大學學報(哲學社會科學版)》為CSSCI來源期刊,國際期刊《計算城市科學》(ComputationalUrbanScience)被國際核心數據庫EI收錄。